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Könntest du das Problem etwas genauer schildern? Sind es mehrere Fenster von demselben Programm ( d.h. z.B. 2 Fenster Internet Explorer ) geöffnet oder sind es verschiedene Programme?
Sind die Fenster gruppiert? Wenn du mehrere Fenster desselben Typs offen hast, werden diese manchmal gruppiert (mehrere Fenster werden über einen Knopf in der Taskleiste angesteuert). Diesen Mechanismus könntest du unter
[Rechter Mausklick auf die Taskleiste] > "Eigenschaften" > "ähnliche Elemente gruppieren" verhindern.
Ansonsten sollten sich nicht mehrere Fenster gleichzeitig öffnen.